主角為三神器的後代，持有草薙家火焰的天才格鬥家，身份為草薙家年輕當家草薙京。事源於大蛇一族意圖復活他們的主、地球的意志之一「大蛇」，並令世界再生，意味著世界毀滅。
有名的綜合格鬥家路卡爾·班舒泰爾（Rugal Bernstein）再次舉辦格鬥天王大賽，主角草薙京與兩名好友二階堂紅丸及大門五郎再度組隊參賽。另一位三神器後代的八神家年輕當家八神庵組織了勁敵隊參賽，兩位背負宿命的年輕當家首度碰面在大賽對戰。大賽後期草薙柴舟受到控制與草薙京對決，草薙京擊敗了父親令他恢復意識。後來亦擊敗舉辦賽事的路卡爾，他道出了自己使用了大蛇之力，最後因力量失控自取滅亡。最後草薙柴舟因將他打敗之事而承認草薙京實力，將草薙家的當家之位傳給草薙京。主人公隊*